Дипломат и первый руководитель экспедиции Атлантиды в галактику Пегас. Как эксперт в сфере международных отношений, доктор Вейр была известна за пределами Соединенных Штатов. Когда президент Генри Хейс пришел к власти в 2004 году, он назначил Элизабет на должность руководителя SGC после того, как генерала Джорджа Хаммонда перевели. В последующие месяцы Вейр давала полный отчет о программе Звездные врата вице-президенту Кинси и его отделу, который контролировал программу.

В связи с повышением Джека О’Нилла Вейр была переведена на аванпост Древних в Антарктике. Это все, что осталось после исчезновения города Атлантиды 5-10 миллионов лет назад. Когда Дениэл Джексон определил правильный адрес затерянного города, Элизабет вызвалась возглавить экспедицию смельчаков, готовых пройти через врата.

Именно доктор Джексон рекомендовал Вейр, как дипломата для разрешения конфликта, нависшего между Ток’ра и Землей. Она говорит на пяти языках, включая русский и латынь (последний напоминает язык Древних). В свое время Вейр помогла решить дюжину весьма сложных международных вопросов. После ее посредничества в Северной Африке президент Хейс решил, что свои качества она вполне сможет применить и на другом месте работы.

Изначально Вейр испытывала антипатию к военным. Ее карьера в правительстве началась с того, что она активно выступала против полного контроля военным ведомством. По ее словам, лучший способ остановить распространение оружия – это свести на нет его использование в мире. Но когда ее назначили на Атлантиду, под ее началом оказался и военный контингент экспедиции.

На Земле у Элизабет остался самый близкий человек (если не считать ее собаки Седжвик): мужчина по имени Саймон Уоллес. Вернувшись почти через год на Землю, она узнает, что за время ее отсутствия Саймон встретил другую.

Вейр вернулась на Атлантиду, где продолжила ежедневно решать этические и военные вопросы. И хотя она всегда стремилась разрешить все возникающие конфликты мирным способом, ей пришлось смириться с тем, что не всегда это действенно. Особенно, когда сталкиваешься с такими безжалостными врагами, как рейфы и репликаторы – врагами, угрожающими существованию человечества в целом. Но с некоторыми все-таки Элизабет ожидал успех. Например, с дженаями.

После трех лет на посту руководителя экспедиции, в течение которых МНК (правительственный орган, курирующий экспедицию) поднимало вопрос о ее компетенции, доктор Вейр была смертельно ранена, когда на Атлантиду был направлен спутник репликаторов. Она была на грани смерти, и единственным решением было активировать наниты в ее теле, которые остались после истории, случившейся год назад. Родни МакКей перепрограммировал наниты на исцеление тела Элизабет, но теперь она стала частью программы репликаторов.

Этот факт помог Элизабет войти в общее сознание врага и помочь Шеппарду достичь успеха в опасном задании, которое должно было спасти Атлантиду. Сама же Элизабет отвлекла на себя внимание лидера репликаторов, Оберота, чтобы ее люди смогли бежать. Она же осталась в лапах врагов.