Гоаулды Ток'Ра в очередной раз были вынуждены бежать со своей базы, преследуемые врагами. Так как нападение, как всегда, застало их врасплох, они были вынуждены бежать на базу Альфа, координаты которой были известны Джейкобу, замыкавшему колонну беглецов. С уходом им помогали ЗВ-1 с подкреплением с базы Звёздных врат и доктором Фрейзер, а также свободные джаффа во главе с Тилком и Братаком. Пока беженцы переводили дух, некоторые из джаффа и Ток'Ра сразу же неполадили друг с другом, Тилк с Братаком и Джейкоб/Сэлмак, возглавлявший, в свою очередь, Ток'Ра, с трудом удерживали свои "армии" от открытого столкновения. И тут какой-то неизвестный враг стал дерзко убивать присутствующих на базе.

Жители планеты Пангар, с которыми были установлены дипломатические отношения, владели лекарством от всех болезней. Этот удивительный препарат называется третонин! Проблема была только в том, что он вызывает зависимость, как наркотик. А получают они его из личинок гоаулдов. Пангарцы не пользовались Звёздными вратами, и сразу встал вопрос, где они взяли столько симбионтов? Те были вынуждены сознаться, что нашли... королеву гоаулдов! Она была очень стара, её тело слабело, и она умирала. Тилк с Джонасом расшифровали письмена в гробнице, где пангарцы нашли её. Оказалось, что Эдгерия была предательницейй гоаулдов, и сам Ра замуровал её здесь 2000 лет назад. Это было достаточно, чтобы Тилк понял, что она - прародительница Ток'Ра!

Информация о секретном проекте под названием "Прометей" попала в прессу, и Сэм с Джонасом в обмен на молчание были вынуждены показать Прометей съёмочной группе. А съёмочная группа оказалась террористами, которые захватили корабль. Это оказалось делом рук приспешников полковника Симонса, арестованного в 5 сезоне и гоаулда, с которым он работал. Арестантов привезли на корабль, и пришлось дать им улететь, иначе террористы взорвали бы гипердвигатели на основе наквадрии. Пока гоаулд на орбите налаживал гипердвигатели для гиперпрыжка, Джек и Тилк догнали Прометей на глайдере и сумели пробраться внутрь. Корабль удалось отвоевать, и, пока освобождённые думали, что делать, появился Тор на своём корабле: родной мир асгардов наводнён репликаторами, поэтому ему нужен Прометей и ЗВ-1 для помощи...

Тор рассказал, что, изучив андроида Рис, асгарды нашли команду, с помощью которой удалось созвать всех репликаторов на планету Хала, где асгарды оставили устройство замедления времени, что должно было дать им так необходимое время для того, чтобы найти способ покончить с насекомыми. Но, к сожалению, репликаторы завладели устройством раньше, чем оно включилось. Они изучили его и даже запустили ускорение времени. ЗВ-1 должны были исправить эту ошибку, а это было возможно, так как Прометей слишком примитивен, чтобы привлекать внимание репликаторов. Очутившись на планете, ЗВ-1 обнаружили третье поколение репликаторов, которые были подобны Рис, то есть уже имели форму не пауков, а людей...