Часть 1

 

После блистательной победы над Анубисом герои решали, что делать дальше. Друзья Джека были озабочены одной мыслью: как помочь полковнику, для мозга которого единственным спасением стала камера для стазиса. И пока Элизабет Вейр, как дипломат, одновременно разбиралась по поводу найденного аванпоста, к которому мировые державы желали иметь доступ, друзья предложили отправиться на поиски Тора самим. Но доктор Вейр была вынуждена отклонить просьбу, так как Прометей был единственным кораблём Земли, и посылать его сейчас неведомо куда неразумно. Тем не менее, Сэм вспомнила о грузовом корабле, на котором друзья летали на Таонас, и о том, что Джек модернизировал его гипердвигатель, поэтому полёт в галактику асгардов был вполне возможен. Доктор Вейр согласилась отпустить Тилка и Сэм на поиски Тора, а доктор Джексон был вынужден остаться на базе, так как он один понимал язык Древних. К тому же от Системных лордов неожиданно поступило сообщение с предложением переговоров. 

 

Часть 2

 

Явившиеся на базу Звёздных врат Ю, Аматэрасу и Камул были недовольны переговорами и собрались уходить - посовещаться со своими. Однако по указанию Дэниела в последний момент гости были арестованы: оказалось, что кто-то из них послал сообщение с заданием проверить, не блефуют ли жители Таури относительно оружия Древних, поэтому к Земле скоро прилетит корабль гоаулдов. Но вместо него появился корабль Тора "Дэниел Джексон", на борту которого находился так же и Тилк: после того, как репликаторы, возглавляемые Пятым, выбрались с Халы и достигли нового дома асгардов Ориллы, флот сереньких человечков уничтожил корабль Пятого, но блоки репликаторов упали на планету и продолжили своё дело. А Пятый продолжал удерживать в плену майора Картер. Поэтому Тору нужен был полковник О'Нилл с его знаниями Древних. 

Пока обломки кораблей Анубиса продолжали летать на орбите Земли, МКС была вынуждена совершать манёвры уклонения, чтобы избежать опасных столкновений. Внезапно в станцию ударил необычный энергетический импульс, и связь прервалась. А на базу Звёздных врат вскоре после этого прибыл полковник российских ВВС Алексей Веселов, предложивший занять вакантное место в ЗВ-1, однако, генерал О'Нилл, конечно, отказал во всём, пока полковник не пройдёт соответствующую тренировку. Пока доктор Джексон приносил расстроенному полковнику извинения, начали происходить странные вещи: полковник Веселов оказался болен, а главное, не помнил, как оказался на базе Звёздных врат, а Дэниелом после контакта с ним овладело какое-то помешательство. Заподозрив инфекцию и эпидемию, Джек был вынужден закрыть базу на карантин.

Пока генерал О'Нилл привыкал к своему новому месту командира базы Звёздных врат, его бывшие подопечные не вернулись с разведывательной миссии на одну из планет Анубиса, а после этого Баал продемонстрировал, что уже завладел некоторыми технологиями, когда его голограмма явилась на базу через Звёздные врата и потребовала отдать оставшегося на Земле Камула в обмен на якобы пленённых им членов Первого отряда.

Дэниел очнулся на незнакомой планете в постели красивой незнакомки: он был ранен, и незнакомка ухаживала за ним. Звездные Врата в этом мире так же стали яблоком раздора и причиной гражданской войны. Группа фанатиков, которые верят, что портал построен для возвращения Богов, свергла законное правительство и завладела Звёздными Вратами. Саманта с Тилком успели вернуться на Землю, а Дэниел – нет, и теперь его судьба зависит от лидера повстанцев - Сорена.