Дэниэл — археолог и лингвист, который свободно разговаривает на двадцати трёх языках («1969») и легко подхватывает новые; на экране он разговаривал по-английски (его родной язык), на древнеегипетском, по-испански, по-русски, по-китайски и по-немецки. Он также выучил языки гоа’улдов, Древних и Унасов. Хотя Джексон и обладает энциклопедическими знаниями в разных областях науки (не только в исторических и филологических, но и в естественных), но его нетрадиционные теории, обращавшиеся к распространённым среди «пирамидологов» идеям внеземного происхождения пирамид и культурного единства древнего мира, были в целом негативно встречены его коллегами, представлявшими академическую науку. Джексон рисковал быть отвергнут остальным учёным миром, но к нему обратилась Кэтрин Ленгфорд, привлёкшая его к работе на секретном проекте американских ВВС.

Кинофильм
В фильме Звёздные врата, доктор Джексон использует свои знания о Древнем Египте, чтобы расшифровать надписи на покрывающих камнях, найденных вместе с вратами в 1928. Он понял что символы, принятые остальными за иероглифы или клинопись, на самом деле символизировали созвездия. Соответственно, шесть координат созвездий позволяли определить точку их пересечения, отвечавшую за конкретное место в трёхмерном пространстве Вселенной. Затем ему удалось найти недостающий седьмой символ (шеврон), позволивший открыть устройство под названием «звёздные врата». На своём первом путешествии через врата на пустынную планету Абидос, Дэниэл встречает и влюбляется в местную девушку Ша’ури (в телесериале, её имя звучит как Ша’ре).

Так как Джексон ещё не знал обычаев и языка абидосцев (хотя он и смог правильно определить их родство с североафриканскими народами — Дэниел поначалу говорит, что язык обитателей планеты напоминает туарежский), то он случайно оказывается женат на Ша’ури, дочери племенного вождя жителей Абидоса Касуфа. Благодаря помощи Ша’ури Джексон изучает язык абидосцев и находит способ победить Системного Владыку Ра, поработившего племя Касуфа. После того, как ха’так (корабль-пирамида) Ра был уничтожен при помощи ядерной боеголовки, Дэниэл принял решение не возвращаться домой, а остаться на Абидосе с женой.

Звёздные врата SG-1

Жизнь Джексона опять меняется в телесериале Звёздные врата SG-1, после того как его жену похищает гоа’улд Апофис. Дэниэл присоединяется к команде названной SG-1 с личной целью найти и выручить Ша’ре. Но даже это ему не удаётся — Ша’ре погибает, но Дэниэл остаётся в команде, кроме небольшого отрезка времени когда он был вознесён.

За время своего пребывания в SG-1, Дэниэл был похищен, инфицирован инопланетными вирусами, в его мозг были закачаны 12 сознаний, он умирал и был воскресён много раз используя саркофаг (после чего он испытал период ломки), и возносился в высшее измерение дважды. Ему также вырезали аппендикс (в серии «Возмездие», Шенкс действительно страдал от аппендицита, поэтому его роль была переписана для этой серии).

Его вклады были отмечены дружественной расой Аcгардов — новый флагман главнокомандующего Тора был назван в его честь.

- Что мы будем делать, Чарли?
Чаплин отталкивается спиной от стенки вагона и вытирая рукой выступившие слёзы, печальным голосом произносит:
- Улыбаться...